Inrichtende macht
De school wordt bestuurd door de ouders. De inrichtende macht (het schoolbestuur) draagt de naam VZW Basisschool St.-Jozef Heide. De leden zetelen zolang ze kinderen op de school hebben. Mr. pastoor wordt als lid gecoöpteerd. De directie maakt van ambtswege deel uit van het schoolbestuur.
De inrichtende macht bestuurt de school, wat onder meer het personeels- en fincancieel beleid inhoudt. Daarnaast zijn deze mensen de eerste aanspreekpunten voor allerlei zaken in verband met de organisatie en de dagelijkse gang van zaken op de school.
De zetelende leden worden bij het begin van elk schooljaar in het Schoolkrantje meegedeeld.

Schoolraad
In de schoolraad zetelen vertegenwoordigers van de ouders, de lokale gemeenschap en de leerkrachten. De samenstelling van de schoolraad wordt bij het begin van elk schooljaar via het Schoolkrantje meegedeeld.
   

Schoolcomité(ouderraad)
Samen met de leden van de inrichtende macht vormt de schoolraad het schoolcomité. In het schoolcomité zetelen leden die door de ouders werden verkozen en die bij geen ander bestuurlijk orgaan horen.
Door het schoolcomité (ouderraad) worden allerlei activiteiten van fundraising (vlaaienslag, schoolbarbecue, nieuwjaarsfeest, steuncomité, schoolkalender, …) ingericht om geld in het laatje te krijgen voor de renovatie van de schoolgebouwen.  Grote herstellingen (verwarming, inrichting speelplaats, schilderwerken) waarvoor de subsidiëring ontoereikend is, worden eveneens meegefinancierd met de opbrengsten van de fundraisingacties.